Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 ATP5I-203ENST00000506525 496 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.266e-19■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 29.57□□□□□ -0.884e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.144e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 218.84■□□□□ 0.617e-12■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.835e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.455e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 GRK2-203ENST00000524899 751 ntTSL 319.01■□□□□ 0.635e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PPP1R35-205ENST00000491407 942 ntTSL 533.19■■■□□ 2.96e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PPP1R35-204ENST00000487452 965 ntTSL 233.17■■■□□ 2.96e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.86e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 RHOC-209ENST00000414971 470 ntTSL 315.46■□□□□ 0.074e-13■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-204ENST00000525616 780 ntTSL 227.04■■□□□ 1.922e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 223.17■■□□□ 1.32e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 322.69■■□□□ 1.222e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 319.53■□□□□ 0.722e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 513.61□□□□□ -0.232e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.474e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.668e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 POLE4-201ENST00000233699 602 ntTSL 313.8□□□□□ -0.28e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.184e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 216.34■□□□□ 0.214e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-214ENST00000480194 455 ntTSL 520.57■□□□□ 0.884e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 419.71■□□□□ 0.754e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.624e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-216ENST00000486421 505 ntTSL 518.03■□□□□ 0.484e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.444e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 317.73■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.354e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-218ENST00000491103 871 ntTSL 517.22■□□□□ 0.354e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.144e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 415.03■□□□□ -04e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 514.97□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 413.19□□□□□ -0.34e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 38□□□□□ -1.134e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.322e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SYNGR2-209ENST00000592456 3036 nt13.6□□□□□ -0.232e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PGPEP1-207ENST00000597663 363 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PGPEP1-204ENST00000595552 418 ntTSL 212.86□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 59.83□□□□□ -0.847e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.86e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.396e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 323.37■■□□□ 1.333e-10■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 318.58■□□□□ 0.563e-10■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-10■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.646e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RHOC-218ENST00000528831 463 ntTSL 320.84■□□□□ 0.933e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.978e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 220.07■□□□□ 0.88e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 218.21■□□□□ 0.518e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -06e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.136e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCT8-204ENST00000470450 1872 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.586e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.746e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.35e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 GFER-202ENST00000561710 482 ntTSL 227.12■■□□□ 1.935e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.485e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.445e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 STX5-207ENST00000491231 1719 ntTSL 523.53■■□□□ 1.365e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EPN1-207ENST00000591743 593 ntTSL 423.28■■□□□ 1.322e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.282e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-206ENST00000473405 783 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.252e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 STX5-208ENST00000492066 1627 ntTSL 522.67■■□□□ 1.225e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 15e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.982e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SLC4A2-205ENST00000463414 793 ntTSL 320.78■□□□□ 0.922e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-204ENST00000463837 5235 ntTSL 220.58■□□□□ 0.882e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PKP3-203ENST00000525642 495 ntTSL 220.43■□□□□ 0.862e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-207ENST00000479965 3102 ntTSL 220.19■□□□□ 0.822e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SLC4A2-216ENST00000490898 702 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SLC4A2-215ENST00000488420 610 ntTSL 319.26■□□□□ 0.672e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-205ENST00000472524 779 ntTSL 219.03■□□□□ 0.642e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.522e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 GFER-203ENST00000565658 1365 ntTSL 1 (best)18.08■□□□□ 0.495e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CCDC88B-209ENST00000494080 4563 ntTSL 217.91■□□□□ 0.462e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 SLC4A2-212ENST00000482950 500 ntTSL 417.7■□□□□ 0.422e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CDAN1-202ENST00000562465 2562 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.332e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.315e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 CDAN1-204ENST00000563604 2076 nt15.05■□□□□ -02e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NECAP2-206ENST00000492095 1787 ntTSL 214.8□□□□□ -0.042e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NECAP2-207ENST00000496239 4619 ntTSL 212.65□□□□□ -0.382e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 BAG1-205ENST00000468274 935 ntTSL 39.87□□□□□ -0.834e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-227ENST00000529576 424 ntTSL 219.49■□□□□ 0.718e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 516.82■□□□□ 0.287e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TUSC3-210ENST00000510836 1452 ntTSL 529.8■■■□□ 2.361e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TUSC3-213ENST00000515859 1627 ntTSL 528.54■■■□□ 2.161e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.541e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.831e-6■■□□□ 12.8
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 107.7 ms