Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms