Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms