Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms