Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms