Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms