Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHCEP18577 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms