Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms