Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCBTB2O95199 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms