Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC144AA2RUR9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC144AA2RUR9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms