Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms