Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms