Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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