Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THUMPD1Q9NXG2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms