Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PCDHB16Q9NRJ7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDHB16Q9NRJ7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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