Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PTPRNQ16849 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPRNQ16849 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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