Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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