Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms