Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms