Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms