Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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