Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDSP20132 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDSP20132 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDSP20132 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDSP20132 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDSP20132 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDSP20132 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDSP20132 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDSP20132 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms