Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC175P0C221 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms