Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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