Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms