Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX2Q9Y2T7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX2Q9Y2T7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms