Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNRF3Q9ULT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNRF3Q9ULT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms