Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN1Q9ULB1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NRXN1Q9ULB1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NRXN1Q9ULB1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms