Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf18Q9UK00 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf18Q9UK00 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf18Q9UK00 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf18Q9UK00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf18Q9UK00 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms