Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC5Q9UII4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC5Q9UII4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms