Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN4Q9UHM6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN4Q9UHM6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms