Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF1Q9UH73 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms