Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4AQ9P2Q2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4AQ9P2Q2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMD4AQ9P2Q2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms