Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMG20BQ9P0W2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.2 ms