Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC15Q9P013 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms