Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSRB1Q9NZV6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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