Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDE1Q9NZC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDE1Q9NZC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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