Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC28Q9NX36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms