Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM7SF3Q9NS93 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM7SF3Q9NS93 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms