Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBN5Q9NRC6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN5Q9NRC6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms