Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE4Q9NR33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE4Q9NR33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms