Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED4Q9NPJ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms