Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms