Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KIAA1549Q9HCM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms