Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1Q9H7V2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms