Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB1Q9H4B7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms