Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1BQ9H0U4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1BQ9H0U4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1BQ9H0U4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms