Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFIH1Q9BYX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFIH1Q9BYX4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIH1Q9BYX4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms