Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
KDM5DQ9BY66 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5DQ9BY66 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5DQ9BY66 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms