Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS2Q9BXC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms